Das Freilichtmuseum Mértola verfügt über mehrere Museumszentren: es besteht aus 14 Ausstellungsorte, die in unterschiedliche Gebäude in der Stadt Mértola und in den Ortschaften Mosteiro, Alcaria dos Javazes und Mina de S. Domingos untergebracht sind. Die Besonderheit, dass nicht die gesamte Kollektion an einem einzigen Ort ausgestellt ist, sowie die Themenvielfalt bieten viele Möglichkeiten zur Besichtigung und Gestaltung von Touren. Im Folgenden werden einige beispielhafte Rundgänge aufgeführt, die in Eigenregie unternommen werden können: