Le Musée de Mértola se compose de 14 espaces installés dans plusieurs bâtiments de la ville de Mértola et dans les lieux-dits Mosteiro, Alcaria dos Javazes et Mina de S. Domingos. Le fait que toute la collection ne soit pas exposée au même endroit, et sa grande diversité thématique, offre de nombreuses possibilités de visite et d’organisation d’itinéraires